地方金融监管局“三定”（即定职责、定机构、定编制）后的内设机构均已披露。
近段时间，各地方金融监管局纷纷在官网披露了内设机构的信息，也有地方金融监管局在近一轮人事调整后更新了相关局领导信息。
国家金融监督管理总局系统实施的是“四级垂管”架构，在金融监管总局之下还设有金融监管局、金融监管分局、金融监管支局等。整体来看，各地金融监管局在内设机构设置上与金融监管总局“三定方案”的内设机构设置保持一致，但同时也结合地方金融发展特点又有所差异化。
具体而言，各地金融监管局基本都设立了办公室（党委办公室）、政策法规处、统计与风险监测处、普惠金融处、金融机构准入处、金融消费者权益保护处、打击非法金融活动处、人事教育处（党委组织部）、财务会计处、纪委办公室、机关党委（含党委宣传部），以及相关的各类金融机构监管处室等。
在各地的内设机构中，科技监管处、金融机构准入处、资管机构建管处、打击非法金融活动处或稽查处、行政处罚处、内审处等多为新设。其中，部分地方金融监管局将打击非法金融活动处和稽查处合并设立，多数金融监管局设置了内审处（党委巡察工作领导小组办公室），也有地方由办公室或机关党委等兼任相关职能。
在各类金融机构监管处室设置上，各地金融监管局均不再保留保险中介监管处。此前，金融监管总局在“三定方案”中也明确将财产险监管司（再保险监管司）的监管对象涵盖了保险中介机构，不再保留保险中介监管部。
在北京、上海、深圳等专营机构集中的区域，三地金融监管局均设置了专营机构监管处。多数地方局将股份制银行和外资银行合并监管，设置股份制和外资银行监管处，而北京、上海、广东、重庆等局则单设外资银行监管处，其中外资机构众多的上海局也延续了此前上海银保监局时期的机构设置方案，分设外资银行监管一处和外资银行监管二处。
在非银金融机构监管上，天津、重庆等金融监管局则根据当地非银金融公司众多的情况分设了非银机构监管一处和非银机构监管二处。
对于农村金融机构的监管，除了北京、上海、西藏、深圳四地之外，其他省市金融监管局均设置了农村中小金融机构监管处，其中河北、山西、吉林、安徽、江西、山东、河南、湖南、四川等金融监管局还设置了针对村镇银行等新型农村金融机构的新型农村金融机构监管处，其实这一处室在银保监会时代已在部分银保监局中设立。
此次新设立的资管机构监管处，与金融监管总局新设立的资管监管司相对应。资管监管司主要承担信托公司、理财公司、保险资产管理公司的非现场监测、风险分析和监管评价等工作，根据风险监管需要开展现场调查，采取监管措施，开展个案风险处置。北京、天津、上海、浙江、山东、河南、湖北、陕西等地金融监管局分别设置了资管机构监管处。
自贸区金融监管制度在相关地方的机构设置中也有所体现。例如，上海、广东、海南、深圳等均都单设了相关处室，其中上海局为政策研究处（自贸处），广东和深圳局为自贸区监管处，海南局则设置了自贸港监管处。
在此前的地方银保监局内设机构中，已经出现过的地区监管协调处也在部分地方金融监管局有所延续。例如，河北、江苏、浙江、湖北、湖南、广东等地金融监管局均设置了与省会相对应的地区监管协调处，主要负责省会地区金融业整体监管工作统筹。
